A Ninja ZX-6R erőteljes, merev, radiálisan szerelhető monoblokk féknyeregekkel rendelkezik, kiváló érzetet biztosítva a fékkaron. A nagy átmérőjű, félig lebegő ø310 mm-es rozsdamentes féktárcsák hozzájárulnak az erős fékezéshez.
A hátsó kereket egy ø220 mm-es hullámos féktárcsa lassítja le.
A Ninja ZX-10R-ről származó könnyű hátsó féknyereg a kiváló teljesítményt és kontrollt kínál.
A hátsó fékpedál a lábtartóval koaxiálisan van felszerelve a kiváló fékpedálérzés érdekében.
A Bridgestone legújabb sport gumiabroncsai, a BATTLAX HYPERSPORT S22, hozzájárulnak a könnyebb kezelhetőséghez, miközben kiváló tapadást biztosítanak mind száraz, mind nedves úton, ami nagyobb önbizalmat és élvezetet eredményez.